Transportasi penyeberangan memegang peranan sangat penting mengingat saat ini untuk mencapai ibukota Kota Tidore Kepulauan dari Ternate dicapai dengan speed boat dari pelabuhan Bastiong sekitar 10 menit. Selain dari pelabuhan Bastiong, dapat juga melalui pelabuhan Bastiong ke pelabuhan Rum dengan menggunakan ferry. Untuk prasarana laut yang sudah tersedia yang mempunyai tingkat pelayanan yang cukup adalah pelabuhan di Rum. Untuk kapal penumpang lebih banyak menggunakan speed boat dan sebagian menggunakan kapal kayu. Pelabuhan Rum sendiri masuk dalam pelabuhan kelas II dengan panjang dermaga 6o meter, konstruksi beton yang berfungsi sebagai kantor pelayaran (Kanpel) dan memiliki sarana pergudangan. Untuk jalur transportasi laut menuju Kota Tidore Kepulauan mudah didapatkan karena moda transportasi yang cukup bervariasi yaitu kapal Very, kapal motor speed boad yang jumlahnya cukup banyak. Lama perjalanan bervariasi tergantung pada jenis transportasi yang dipilih, untuk speed boat biasanya 10 menit, dan untuk kapal motor biasanya ditempuh untuk 1 jam.